MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03 chromosome

Total Repeats: 6840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010278	ATT	2	6	1497	1502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010278	ATT	2	6	2626	2631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010278	T	6	6	3772	3777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010278	ATTT	2	8	3789	3796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010278	TG	3	6	4406	4411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010278	ATA	2	6	4439	4444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010278	TAG	2	6	4476	4481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010278	AAAT	2	8	4514	4521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010278	ATTA	2	8	5677	5684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010278	A	7	7	5711	5717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010278	TTAT	2	8	5735	5742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010278	TGT	2	6	5775	5780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010278	ATA	2	6	5787	5792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010278	CGTT	2	8	6102	6109	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010278	TCAA	2	8	6984	6991	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010278	TAA	2	6	7036	7041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010278	AAT	2	6	7055	7060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010278	AAGC	2	8	9353	9360	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010278	T	7	7	9401	9407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010278	CAAA	2	8	9422	9429	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010278	AAC	2	6	9453	9458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010278	GTG	2	6	9494	9499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010278	ATAA	2	8	10038	10045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010278	CTTT	2	8	14928	14935	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010278	AAAG	2	8	14944	14951	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010278	AAAG	2	8	14957	14964	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010278	GCAA	2	8	15033	15040	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010278	GGA	2	6	15086	15091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010278	AATA	2	8	15108	15115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010278	AGAT	2	8	15122	15129	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010278	GTG	2	6	16544	16549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010278	TCG	2	6	16561	16566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010278	AAT	2	6	16611	16616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010278	TAA	2	6	17775	17780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010278	CAA	2	6	20294	20299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010278	A	6	6	20315	20320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010278	CTTT	2	8	20338	20345	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010278	AAC	2	6	20375	20380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010278	A	7	7	20390	20396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010278	CAA	2	6	21514	21519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010278	ACA	2	6	21546	21551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010278	A	6	6	22997	23002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010278	ATA	2	6	23066	23071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010278	A	7	7	24016	24022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010278	GTCC	2	8	24030	24037	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010278	ATTA	2	8	24090	24097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010278	T	6	6	24793	24798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010278	ATA	2	6	24805	24810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010278	TGA	2	6	28329	28334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010278	T	7	7	28348	28354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010278	T	7	7	30176	30182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010278	AAC	2	6	30187	30192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010278	A	7	7	30215	30221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010278	TTG	2	6	30229	30234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010278	A	6	6	33437	33442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010278	A	7	7	35142	35148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010278	A	7	7	35176	35182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010278	A	6	6	35217	35222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010278	AAG	2	6	36882	36887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010278	ACC	2	6	36897	36902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_010278	ATTT	2	8	36991	36998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010278	ATA	2	6	37506	37511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010278	TCA	2	6	37520	37525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010278	AAT	2	6	38118	38123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010278	TTAGG	2	10	38135	38144	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010278	T	6	6	38827	38832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010278	ATTT	2	8	38837	38844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010278	T	6	6	40029	40034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010278	A	7	7	40494	40500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010278	TATG	2	8	40812	40819	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010278	TCT	2	6	41312	41317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010278	T	6	6	41973	41978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010278	CAA	2	6	42036	42041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010278	CTT	2	6	43860	43865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010278	A	6	6	43883	43888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010278	A	6	6	45105	45110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010278	ATC	2	6	45829	45834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010278	GAA	2	6	45845	45850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010278	TAAA	2	8	46616	46623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010278	A	6	6	46621	46626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010278	AAT	2	6	46675	46680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010278	AT	3	6	48077	48082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010278	TGTAA	2	10	48147	48156	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010278	AATC	2	8	51004	51011	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010278	TGTT	2	8	51013	51020	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010278	TAA	2	6	51028	51033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010278	ATT	2	6	51058	51063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010278	T	7	7	52058	52064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010278	ATGCA	2	10	52114	52123	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_010278	T	6	6	52210	52215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010278	GAA	2	6	52224	52229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010278	TA	3	6	52242	52247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010278	A	6	6	52260	52265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010278	ATA	2	6	52290	52295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010278	T	6	6	52296	52301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010278	TAT	2	6	52336	52341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010278	A	6	6	52361	52366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010278	T	6	6	54348	54353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010278	ACA	2	6	54457	54462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010278	TAA	2	6	54479	54484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010278	TCT	2	6	55261	55266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010278	A	6	6	55839	55844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010278	T	7	7	55866	55872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010278	A	6	6	57178	57183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010278	AATA	2	8	57215	57222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010278	TGA	2	6	57248	57253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010278	GCT	2	6	59237	59242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010278	T	7	7	59262	59268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010278	T	6	6	59273	59278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010278	AAT	2	6	59338	59343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010278	GAAT	2	8	59361	59368	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010278	TTTAAT	2	12	59668	59679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010278	TTC	2	6	60419	60424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010278	A	6	6	60433	60438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010278	T	6	6	60515	60520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010278	TTAA	2	8	60595	60602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010278	AAG	2	6	60604	60609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010278	A	6	6	62380	62385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010278	GAAT	2	8	62390	62397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010278	T	7	7	62410	62416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010278	AGATAA	2	12	62725	62736	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010278	T	6	6	62804	62809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010278	TAA	2	6	63631	63636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010278	AGA	2	6	63652	63657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010278	TAAA	2	8	65854	65861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010278	ATT	2	6	66392	66397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010278	GCTT	2	8	66412	66419	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_010278	TAG	2	6	66423	66428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010278	A	7	7	66432	66438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010278	AAT	2	6	66469	66474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010278	TA	4	8	67444	67451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010278	AT	3	6	67474	67479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010278	AAT	2	6	67508	67513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010278	T	7	7	67632	67638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010278	CA	3	6	67684	67689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_010278	ACG	2	6	67690	67695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010278	TGT	2	6	67699	67704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010278	CGT	2	6	67726	67731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010278	T	6	6	67734	67739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010278	AAC	2	6	67747	67752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010278	TG	3	6	67766	67771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010278	TTG	2	6	67777	67782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010278	A	6	6	67796	67801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010278	TAA	2	6	67822	67827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010278	TTGAA	2	10	67926	67935	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010278	GGC	2	6	67965	67970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_010278	GCTT	2	8	68010	68017	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_010278	CGA	2	6	68025	68030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_010278	CGA	2	6	68204	68209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_010278	GCA	2	6	68278	68283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_010278	G	6	6	68303	68308	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_010278	GGA	2	6	113808	113813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
433	NC_010278	TGT	2	6	113822	113827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_010278	TAA	2	6	114588	114593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_010278	TGC	2	6	114789	114794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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454	NC_010278	TAA	2	6	114861	114866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_010278	GAA	2	6	115007	115012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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458	NC_010278	AAGTA	2	10	115113	115122	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_010278	A	6	6	115332	115337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_010278	CGG	2	6	115776	115781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
467	NC_010278	TAA	2	6	115782	115787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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